Ученые улучшили алгоритмы сборки рнк благодаря онлайн-игре
Методы сборки молекул РНК, придуманные участниками онлайн-игры EteRNA, разрешили создать метод, намного лучше существующих, говорится в статье, размещённой в издании Proceedings of the National Academy of Sciences.
«Это было бы нереально, если бы игроки в EteRNA структуры, применяя онлайн-симулятор. Синтезируя самые удачные структуры в лаборатории Рхиджу Даса (Rhiju Das) в Стэнфорде, мы даем сообществу обратную сообщение — что трудится, а что нет в реальности. В следствии любители помогли нам осознать правила сборки РНК и значительно расширили возможности науки», — пояснил Андриан Трейе (Adrien Treiulle) из Университета Карнеги-Меллона в Питтсбурге (США).
Онлайн-игра EteRNA разрешила консолидировать силы 37 тысяч любителей, решавших двумерные головоломки, связанные со сборкой молекул РНК. Наряду с этим они приобретали от Трейе и его сотрудников экспериментальные результаты, в которых молекулы РНК в действительности синтезировалась по придуманным ими правилам.
Применяя способы машинного обучения,
ученые создали на базе самые удачных способов сборки РНК метод EteRNAbot. Они сравнили эффективность работы игроков, метода EteRNAbot и двух современных методов для разработки структур молекул РНК.
На расчет структуры молекулы у компьютера уходит менее 60 секунд, тогда как у человека это занимает 1–2 дня. Плюс проверка в лаборатории занимает месяц, и в целом тестирование заняло год. Результаты продемонстрировали, что
структура, созданная человеком, в 99% случаев превосходит результаты работы простого метода, тогда как структуры, созданные EteRNAbot — в 95%. Сейчас исследователи собираются включить в игру сборку трехмерных структур.
Неестественные молекулы РНК с заблаговременно заданными особенностями позволяют изучить живые совокупности и руководить их работой.
Но пока методы, каковые употребляются для расчетов нужной структуры РНК, несовершенны, исходя из этого при синтезе молекулы довольно часто не владеют нужными особенностями.
